ZHIXUAN Universal DNA Library Prep Kit for Illumina V3

 

Kit de preparação de biblioteca universal de DNA ZHIXUAN para Illumina V3

Sequenciamento de genoma completo | Sequenciamento de exoma completo ou outro sequenciamento de captura direcionado | Sequenciamento de amplicon | Sequenciamento de imunoprecipitação | Sequenciamento metagenômico | Sequenciamento de metilação

O ZHIXUAN Universal DNA Library Prep Kit para Illumina V3 é um kit de preparação de biblioteca especialmente otimizado para a plataforma de sequenciamento de alto rendimento Illumina. Este kit pode converter 100 pg - 4 μg de DNA de entrada em bibliotecas dedicadas para a plataforma de sequenciamento de alto rendimento Illumina. Como uma nova versão atualizada, o ZHIXUAN Universal DNA Library Prep Kit para Illumina V3 melhorou significativamente a taxa de conversão da biblioteca e a saída de amplificação da biblioteca por meio de melhorias gerais no módulo de reparo final, módulo de conexão e módulo de amplificação da biblioteca. É amplamente utilizado na construção de bibliotecas PCR ou PCR-Free de várias amostras e é compatível com processos de captura direcionados. Todos os reagentes fornecidos no kit passaram por rigoroso controle de qualidade e validação funcional, o que garante muito a estabilidade e repetibilidade da construção da biblioteca.

Este produto é compatível com uma variedade de tipos de amostra: DNA genômico, DNA livre (cfDNA, ctDNA), DNA de secção de parafina (DNA FFPE), DNA imunoprecipitado (DNA ChIP), múltiplos amplicons, etc.

·Menor tempo de preparação da biblioteca, uma única preparação da biblioteca leva apenas 75 minutos.
·Maior eficiência de conexão do adaptador, maior taxa de conversão da biblioteca
·Operação mais fácil e rápida, a mistura reduz erros de operação.

·Maior faixa de compatibilidade de modelo, o DNA de entrada inicial pode ser de 100 pg a 4 μg.
·Maior compatibilidade de amostra, adequado para DNA fragmentado, cfDNA, DNA FFPE, DNA ChIP, etc.

Nota: K* e N* representam produtos homogêneos da Empresa K e da Empresa N

Figura 1.  Bibliotecas são construídas com DNA fragmentado de células T HEK239. O DNA de entrada é 100 pg, 1 ng, 100 ng e 1 μg, respectivamente. Bibliotecas são construídas de acordo com suas IFUs correspondentes e a comparação é feita entre as saídas de biblioteca amplificadas.
Os resultados mostram que para diferentes quantidades iniciais de DNA de entrada, a saída da biblioteca do ZHIXUAN Universal DNA Library Prep Kit para Illumina V3 é muito maior do que a de outros produtos homogêneos sob as mesmas condições de ciclo de amplificação.

Figura 2: 1 ng cfDNA, 10 ng FFPE DNA e 1 μg gDNA são usados ​​para construir bibliotecas, respectivamente. As bibliotecas são construídas de acordo com o IFU correspondente de cada produto, e as saídas das bibliotecas amplificadas são comparadas. Os resultados mostram que, para bibliotecas de diferentes fontes, a saída do ZHIXUAN Universal DNA Library Prep Kit para Illumina V3 é muito maior do que a de outros produtos homogêneos sob as mesmas condições de ciclo de amplificação.

O produto deve ser armazenado em ambiente com temperatura entre -30°C a -15°C.

Para transporte, é necessária uma faixa de temperatura entre -20°C e 0°C.


Perguntas frequentes

Q1: Baixa saída da biblioteca A1:

(1) Quantifique novamente a quantidade do modelo de entrada para verificar se a quantidade do modelo inicial está correta. Se estiver abaixo do limite inferior (1 ng), a quantidade de entrada do modelo deve ser aumentada;

(2) Se a qualidade do modelo for ruim, o número de ciclos pode ser aumentado apropriadamente de acordo com o IFU ou modelos de alta qualidade podem ser usados;

(3) Verifique se cada etapa do sistema e procedimento é realizada de acordo com o IFU.

(4) O processo de secagem das esferas magnéticas de purificação da biblioteca não deve ser muito longo, o que faz com que as esferas magnéticas fiquem muito secas. A secagem excessiva também reduzirá a saída;

(5) Ao conduzir a amplificação da biblioteca, certifique-se de que não haja resíduos de esferas magnéticas. Caso contrário, pode inibir a reação de amplificação;

(6) Ao quantificar a biblioteca qPCR, certifique-se de que o tempo do ciclo e o número de ciclos estejam corretos.

 

Q2: Após a construção da biblioteca, a proporção de quimeras é alta.

R2: Essa situação é devido à superamplificação. Bibliotecas superamplificadas são amplificações não específicas causadas por incompatibilidades diretas entre bibliotecas quando os primers foram esgotados, e quimeras não intencionais são introduzidas. 

 

Q3: O mesmo índice é adicionado a amostras diferentes, como resolver isso?
R3: Separe amostras com o mesmo índice em diferentes faixas para sequenciamento.

 

Q4: O Agilent 2100 detecta uma característica de pico distinta de dímeros adaptadores.
A4: (1) O multiplicador da purificação de esferas magnéticas pode ser adequadamente reduzido;
(2) A concentração do adaptador pode ser adequadamente reduzida.